Fungsi identifikasi merupakan salah satu fungsi yang penting dalam kepolisian, identifikasi kepolisian selama ini masih dilakukan secara manual, oleh karena itu Polres Kudus secara proaktif menerapkan CAAFIS sebagai modernisasi dalam bidang identifikasi, yang mana pelaksanaan CAAFIS di Polres Kudus telah dilakukan secara komputerisasi dan telah memberikan banyak kemudahan baik untuk petugas maupun bagi masyarakat.